לאחר שעזב את הישיבה החל לשמש כרב צבאי בבסיס חיל התותחנים של [[צה"ל]] שבשיבטה עד לשנת [[תשס"ו]] אז החל לשמש כסגן רב פיקוד העורף - תפקיד אותו סיים למלא בשנת [[תש"ע]].
לאחר סיום שירותי שירותו הצבאי החל לעבוד ב"[[תורת חב"ד לבני הישיבות]]" במסגרת עבודתו היה מוסר שיעורים באולפנות, בישיבות הסדר וכדומה.
בנוסף לעיסוקו במסירת שיעורים והרצאות בעניני חסידות, עוסק הרב מלכיאלי גם בכתיבה ועריכה של עניני חסידות בשפה ברורה ופשוטה.