ישנם הסוברים שבמקום שבו עומד כיום החדר השמאלי עמד בזמן התנאים בית מדרשו של התנא רבי נחוניא בן הקנא{{מקור}}
===קומת המרתף===
בקומה התחתונה של [[בית הכנסת]] מתחת לפני הקרקע, ממוקם [[מקווה טהרה]] המשרת את המתפללים, וכן בית כנסת נחלת דוד שמקיים תפילות בשבת ופעילויות נוספות.