ישיבת תומכי תמימים אור יהודה נוסדה בחודש אלול בשנת תשס"ד, כמסגרת לישיבה קטנה (מונה נכון לשנת תש"ע כ-100 תלמידים). בשנת תשס"ט, נפתחה גם מסגרת לישיבה גדולה (מונה נכון לשנת תש"ע כארבעים תלמידים).
ישיבה גדולה
- צוות
- הרב שלום בער הנדל - ראש הישיבה.
- הרב משה רוזנבלט - מנהל רוחני ומשגיח כללי.
- הרב זאב רויטמן - משגיח ומשיב.
- רמים
- הרב יהושע מנחם ניוהויזר - שיעור א'.
- הרב משה רוזנבלט - שיעור ב'.
- הרב ברוך ציקשווילי - שיעור ג'.
- משפיעים
- הרב דוד אבא זלמנוב - שיעור א'.
- הרב אורי למברג - שיעור ג'.
- הרב יצחק אהרן אקסלרוד.
- הרב מנחם מענדל פלדמן.
ישיבה קטנה
- ראש הישיבה: הרב שלום בער הנדל.
- מנהל אדמניסטרטיבי: הרב עמנואל מזרחי.
- משגיח ראשי - הרב לוי יצחק שמח.
- ר"מים
- שיעור א': הרב צמח תעיזי.
- שיעור ב': הרב שמואל קליינמן.
- שיעור ג': הרב שלום בער הנדל.
- משפיעים
- שיעור א': הרב יוסף יצחק שוורץ.
- שיעור ב': הרב לוי יצחק שמח, הרב יוסף יצחק קליינמן.
- שיעור ג': הרב יוסף יצחק בקשי.